代表本土10万个教会的美国基督教协进会（National Council of Churches USA）属左翼基督教派组织。他们向奥巴马发出祝贺，并承诺将会支持这位在美国处于种种困境中上任的新总统。
美国基督教协进会总秘书长Michael Kinnamon在周三早上发表的声明中说："大选胜出的奥巴马先生，代表4千5百万基督徒的全国基督教协进会成员们已经准备好与你合作去对现实作出回应，这现实是爱的上帝每天摆在我们面前的。"
同时，他也特别指出协进会对贫困、教育、医疗的关注。他说："我们所有人都是依靠上帝的爱和慈悲，我们也将定期为你和其他领袖层成员祷告，愿你能够很好的发挥你的智慧与洞察力，愿你身体健康。"
但是，保守的基督教团体则对奥巴马胜出有不同的反应。这些团体大多对维护传统家庭有强烈的负担，他们对同性恋、堕胎等议题非常关注，因此也特别担心奥巴马在这些问题上的自由立场。
其中，最著名的保守组织"聚焦家庭"（Focus on the Family）感到高兴的是，虽然此次民主党在众议院和参议员都赢得了大多数席位，但是他们在参议院只是56个席位，并没有达到60个， 从而使得奥巴马无法自由使用自己权利为一些诸如同性婚姻、堕胎等受争议的议题透过立法程序得以合法化。
另一家保守团体FOTF Action对此表示了类似的观点，他们认为，下任参议院保持这样的情形，可以间接阻止同性婚姻合法化。负责人Tom Minnery曾在大选直播中表示："上帝能够使用任何一位总统达成自己的目的。"
同时，另外一个著名的保守组织Family Research Council鼓励关注道德价值观的选民们仍旧为美国祷告，不要失去信心。他们的前任职员、现在是另外一家反对堕胎的组织Americans United for Life执行总裁的Charmaine Yoest对奥巴马表示祝贺，但同时质疑他在堕胎上的不确定态度。
奥巴马早前曾在竞选中发表达支持堕胎权的观点遭到多位基督教领袖的批评。他也曾承诺说，如果他当选，上任后第一个要签署的法案就是自由选择法案(Freedom of Choice Act)，内容是减少各州以及联邦法律对堕胎的限制。
Charmaine Yoest誓言他们日后将继续教育美国人民认识到这一法案带来的危害，同时，他们将会与反对堕胎的选民们联合起来一起来推动反对堕胎、保护生命这一重要的议题，无论他们是共和党还是民主党。
据CNN报导，有民调显示74%的白人福音派选民或重生的基督徒投票支持共和党候选人麦凯恩，24%人群支持奥巴马。26%的选民认为自己是福音派或者重生的基督徒。
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