代表本土10萬個教會的美國基督教協進會（National Council of Churches USA）屬左翼基督教派組織。他們向奧巴馬發出祝賀，並承諾將會支持這位在美國處於種種困境中上任的新總統。
美國基督教協進會總秘書長Michael Kinnamon在週三早上發表的聲明中説：「大選勝出的奧巴馬先生，代表4千5百萬基督徒的全國基督教協進會成員們已經準備好與你合作去對現實作出回應，這現實是愛的上帝每天摆在我們面前的。」
同時，他也特別指出協進會對貧困、教育、醫療的關注。他説：「我們所有人都是依靠上帝的愛和慈悲，我們也將定期為你和其他領袖層成員禱告，願你能夠很好的發揮你的智慧與洞察力，願你身體健康。」
但是，保守的基督教團體則對奧巴馬勝出有不同的反應。這些團體大多對維護傳統家庭有強烈的負擔，他們對同性戀、墮胎等議題非常關注，因此也特別擔心奧巴馬在這些問題上的自由立場。
其中，最著名的保守組織「聚焦家庭」（Focus on the Family）感到高興的是，雖然此次民主黨在眾議院和參議員都贏得了大多數席位，但是他們在參議院只是56個席位，並沒有達到60個， 從而使得奧巴馬無法自由使用自己權利為一些諸如同性婚姻、墮胎等受爭議的議題透過立法程序得以合法化。
另一家保守團體FOTF Action對此表示了類似的觀點，他們認為，下任參議院保持這樣的情形，可以間接阻止同性婚姻合法化。負責人Tom Minnery曾在大選直播中表示：「上帝能夠使用任何一位總統達成自己的目的。」
同時，另外一個著名的保守組織Family Research Council鼓勵關注道德價值觀的選民們仍舊為美國禱告，不要失去信心。他們的前任職員、現在是另外一家反對墮胎的組織Americans United for Life執行總裁的Charmaine Yoest對奧巴馬表示祝賀，但同時質疑他在墮胎上的不確定態度。
奧巴馬早前曾在競選中發表達支持墮胎權的觀點遭到多位基督教領袖的批評。他也曾承諾説，如果他當選，上任後第一個要簽署的法案就是自由選擇法案(Freedom of Choice Act)，內容是減少各州以及聯邦法律對墮胎的限制。
Charmaine Yoest誓言他們日後將繼續教育美國人民認識到這一法案帶來的危害，同時，他們將會與反對墮胎的選民們聯合起來一起來推動反對墮胎、保護生命這一重要的議題，無論他們是共和黨還是民主黨。
據CNN報導，有民調顯示74%的白人福音派選民或重生的基督徒投票支持共和黨候選人麥凱恩，24%人羣支持奧巴馬。26%的選民認為自己是福音派或者重生的基督徒。
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