台湾大学哲学系副教授柯志明反驳说，主张肛交正当化就是否定人体器官有特定的自然本性，否定人类能知道并判别器官的自然本性，"这都是一种夸大的强词夺理，而毫无理性可言。"
柯教授解释说，肛交的行为超越了器官的自然职能，是不合乎自然的，因为肛门不是为了性交，而是为了排粪便。
但同性恋主义者颠覆普通人的日常判断力，狡辩说"自然的"其实很难定义，因为器官的职能具有多样化，比如嘴巴可以说话、吃喝、唱歌，也可以亲吻；手可以写字、打球、用饭、敲打等。
虽然一些器官的职能确实是多样的，但柯教授指出这不能否认器官有其特定的自然本性。"好比说，没有手的人经练习后学会用脚写字；但不能反过来说，因为脚能用来写字，所以用脚写字就是合乎脚之自然本性。"
"因此，一个器官『能』用来做什么不表示这个器官做这个行为是『自然的』，因为『能』做什么可以由意志决定，但器官的自然使用需合于器官的本性，即器官的存在目的；而器官的存在目的不是受人的意志决定的，而是与人体的其他器官有著整体的关系，人是在人体的活动机能中运用器官的特定职能。"他说。
医学已经证明，不合乎器官本性地使用器官常带来问题与疾病，例如男同性恋性爱行为——肛交容易产生、传播爱滋病就是其中一例。
他还强调，只有极少数器官能被人的意志支配，而且在意志未介入器官时，人体整个器官仍然不断运作以维持身体的存在。
"显然，器官本来就有其先天的职能，展现这个职能的就是它的自然（本性）。所以『能』不等于『自然』。"柯教授说。
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