全國人大會議5月28日以壓倒性票數通過香港版《國安法》並且多處改動草案，強化對香港監管被視為加辣版，引起國際社會關注香港法治與基本自由受壓制。在香港教界，循道衞理、浸信會、榮光敬拜事工教牧與信徒相繼發出聯署聲明，憂慮政權藉法案以言入罪宗教自由盪然無存，要求立即撤回《港版國安法》3千多人響應；天主教區各校聯署憂國民教育捲土重來，1千多人加入。
循道衞理人：《國安法》止亂為虛設紅線為實
循道衞理教牧及信徒5月30日以「一群循道衞理人就『港版國安法』的聯署聲明」為題列出三項聲明。內容指出，當權者以港版國安法止亂為藉口，完全迴避200萬港人要求撒回反送中訴求，特區政府更漠視警暴動輒以「止暴制亂」為名打壓公民社會令社會撕裂，國家及社會要長治久安必先虛心聆聽民意。
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聲明又指，中國政府近年以維護國家安全為名以言入罪無法令人釋懷，而國家安全將成為香港社會無處不在的紅線，市民擔憂動輒得咎，真普選承諾則遙遙無期，一國一制卻近在咫尺此為香港之悲哀。此外，對於近年香港社會在各方面急劇崩壞深感痛心，今天仍以馬再照跑，舞再照跳收買人心對香港人的一大侮辱。
循道衞理人呼籲：「特區政府真誠反映市民憂慮，中央政府尊重國際人權公約及基本法的承諾，廣泛聽取各界不同意見，並重新審議有關法律草擬工作，避免讓香港陷入更嚴峻的境況」；並表示，基督徒在罪惡權勢肆虐之際更需看見真理與真實的可貴，最後以阿摩司先知的話成為禱告與盼望：「惟願公平如大水滾滾，公義如江河滔滔。」（阿摩司書5:24）
聯署發起人包括李鼎新牧師、袁天佑牧師、劉建良牧師、邢福增義務教士等43人或單位；參與聯署者截至6月4日共711人。
浸信會人：促撤回《國安法》逾百各宗派信徒響應
另一聯署發起團體「浸信人公義聯盟」5月31日以「一群浸信會人要求收回《港版國安法》」為題發起聯署聲明，內容指，港版國安法的訂立「徹底撕毀香港一國兩制承諾」、「剝奪港人應有的人身自由」，擔心動輒以言入罪失去宗教自由，更甚出現香港版的王怡牧師，作為基督徒不得不發聲。
聲明亦引用十七世紀浸信會先賢堅持宗教自由、不懼權勢逼害以至殉道為榜樣，呼籲浸信會人豈能沉默。
參與聯署者除了「浸信人公義聯盟」發起人、香港浸信教會會友楊浩然，以及浸信會信徒，亦有來自各宗派人士加入，包括宣道會、信義會、播道會、靈糧堂等。聯署人數截至6月4日共176人並繼續接受聯署。
榮光敬拜事工：盡先知職份斥社會不義
榮光敬拜事工5月31日發起名為《香港基督徒回應國安法聯署聲明》，對法案進一步剝奪港人自由和人權深表憤慨，並宣稱只忠於基督盡先知職份斥社會不義；聯署逾2,500人參與。
聯署聲明以中英文刊於榮光敬拜事工臉書，首先指出來自一班香港基督教教牧和信徒，對於港區國安法剝奪港人自由和人權感憤慨，發出聲明是要表達無畏無懼，鄭重向社會各界作出認信和承諾，聲明共四部分：天國福音、真誠悔罪、忠於基督、守望同行。內容指出，天國福音包含社會制度與文化提升、教會效忠基督盡先知職份斥社會不義等。
基督教界回應港版《國安法》發起的聯署聲明累計約3,400人參與。
天主教區各校聯署：憂國民教育捲土重來
此外，天主教區屬下傳統中學學生及校友亦發起聯署。銅鑼灣天主教女校聖保祿學校「政治關注組」以「保祿人反對『港版國安法』之聯署聲明」推出聯署聲明供全港三間「聖保祿」女校學生及校友參加，強調：「聯署人本著『為一切人，成為一切』的校訓，為所有香港人的福祉，強烈反對港版《國安法》，捍衛香港自由及人權。縱使風雲變色，山岳摧頹，聯署人承諾會繼續負嵎頑抗，打破長達二十三年以來束縛香港的枷鎖。」截至6月4日共1,587人簽署。
兩間傳統天主教男校聖芳濟書院、荃灣聖芳濟中學學生及校友亦發起《反對「港版國安法」》聯署聲明，憂慮國民教育以《國安法》名義捲土重來，成為控制思想的工具，呼籲師生竭力守護香港「珍重自由、人權、獨立思考和博愛精神」。
慈幼英文學校則以反對中國政府破壞「一國兩制」為名發起聯署。
