周一下午五时，十二名扶灵员在圣乐声与管风琴乐声中，把教宗若望保禄二世的遗体从宗座大厦移灵到圣伯多禄大教堂。群众们为了要见教宗的最后一面，甚至要等上八个小时也在所不措，虽然只是匆匆一瞥，但仍执意要向这位教宗致以敬意。
在圣伯多禄大教堂的祭坛正中，教宗身穿白冠红袍，左手腋下夹著十字架权杖，脚穿褐色皮鞋，象征他继续奔走亲近全球民众。梵蒂冈发言人说，教宗的遗体并没有进行防腐。
教宗的丧礼会在香港时间星期五下午四点举行，主管礼仪的主教透露，教宗丧礼将会历时三个半小时，其中包括丧礼弥撒三小时，余下半小时是将棺木移送圣伯多禄大教堂地下室的仪式。波兰外交部表示，预料会有二百万波兰人前往罗马，参加这位波兰出生教宗的葬礼。
因为教宗领导罗马教廷26年，声誉极高，所以出席丧礼的国家元首人数将打破历来元首级葬礼的纪录。教延预料超过二百名国家元首和政要将会出席，包括美国总统乔治布殊、前总统老布殊和克林顿，以及国务卿赖斯，当局又估计，会有多达二百万名信众到梵蒂冈，向教宗作最后告别。
根据教廷所公布的消息指出，教宗的棺木有三层，最内一层使用柏木，中间一层是铅，最外面一层则是核桃木。根据若望保禄二世的遗嘱，他愿意葬在地下，所以，与以往的教宗一样，若望保禄二世亦会埋葬在圣伯多禄教堂的地下墓室。
