在影音使团有关发现"方舟"的专题网站，收录了多位来自各地不同宗派的牧者的言论，表示对掘出"方舟"感振奋，有的更爲由华人发掘出"方舟"而感自豪。亦有牧者表示不论发现是否属实，但亦是一个很大的冲击，是要让人得拯救。
该机构宣称所发现是方舟遗骸的可能性是99.9%后受到外界强烈反应，虽他们之后解释99.9%并非指准确数字，而是为强调其相当高的可能性。不过其言论仍继续遭到抨击及非议。5月28日一基督教文化机构飘流制作主办研讨活动，邀得多位来自不同神学院及教会的学者和牧者，包括曾参与考古研究的教授从考古、释经和布道见证等方面探讨事件。
欠缺严谨的考古精神
浸会神学院曾思瀚博士等教授均认爲该机构宣称发现方舟的做法缺乏了考古过程必要的长期及严谨核证的程序，未符合严谨的考古精神。曾博士指出，考古在步骤上需要有底线才能核实，但就方舟来説没有底线可循，比如哥斐木是什麽至今仍未解开，很难去做研究和核实。
香港神学院的张祥志老师亦指出，圣经原文说的山是衆数，若在一个山峰上发现了木结构，有必要发掘其他山峰是否有同样发现去作推断。
台下一位曾参与考古非利是人的罗教授指出距今历史越长的古物，因欠缺资料作客观判断越难下定论，通常推断90%可能性已是最高，而晚期的文物有古代文献作客观判断，则能推断更高的可能性。
具多年传媒及公关经验的黄赞雄认爲可以"大胆假设"发现的是方舟遗骸，但其后需要"小心求证"，因一个古物被掘出可能性有很多，需要验证排除不可能者去得出结论，才合乎逻辑及才能説服人。
信心不是建立在物件上
而针对有关"发掘方舟能坚固信心"及"不信有方舟等于不信圣经"等言论，会上多名讲者表示若将信仰根基建立在物件上是一种误导。张祥志老师指出圣经的文本意义即上帝想表达的心意，比起文字本身所讲的是否历史事实更爲重要。浸信会神学院邓绍光教授亦指出基督徒的"信"是信靠耶稣是基督，所信是出于圣灵感动；但若是通过某些文物发掘出来去证明上帝可信，这是知识上的可信，顶多是头脑上的相信。
曾思瀚教授亦表示"非古物令人信耶稣"。就算现在知道圣经里记载的耶路撒冷城、有圣殿等真有其物，他质疑"然而要多少古物古迹，才可以令人信耶稣呢？是1 个、2个、2千个，还是2万个呢？"而且考古核实需要长时间，甚至一辈子的时间仍无定论，所以将信心建立在古物上是危险的。
另外迦南堂的关浩然传道表示担心以"方舟不是神话"的布道与原本应以生命、有血有肉的见证有所偏差，以市场导向宣传及举办布道聚会却失落了布道的真意。他还提出事件亦暴露出一些教会错误运用圣经的现象，值得提出及警醒。
发表"528宣言"
当日飘流制作古斌还宣读了"528宣言"，表达作爲信福音的群体应忠于福音，没有任何人事物可以要求对他的忠心等同于对神忠心，作爲学者、牧者、福音同工他们为教会守望，而从方舟事件及其讨论，透视出教会存在一些令人不安的现况，所以透过聚会讨论发掘方舟与释经、信仰、牧养和见证的关系，"关注原则性教导，而不是个别事件"。最后呼吁教会机构的牧者同工并信徒一同建立"负责任的证道、负责任的考古"。
信徒反应热烈
教内信徒对方舟事件亦非常关注，当晚聚会真理堂上下层约500个座位全部爆满，会衆亦积极发言。多人亦表示对"已经发现方舟"的大胆公布有忧心，担心若之后发现所言不实会令听信的人跌倒。
亦有参加者激动地发言，担心过份强调圣经的精意会否勾销了圣经记载了历史的事实。多位讲员再三强调并非要否定"圣经记载了历史"或考古学的意义，而是鼓励以开放态度去诠释及理解圣经信息，并重申支持严谨及客观的考古这一门科学。
当晚研讨会讲员包括浸信会神学院邓绍光教授及曾思瀚教授、香港神学院的张祥志老师、迦南堂的关浩然传道，及基督徒毕业生团契的黄赞雄主任。主办机构飘流制作的负责人古斌以及中大陈龙斌教授担任主持。
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