据《星岛日报》报导，6月1日，印尼日惹特区一群回教居民连同两个回教组织用石头乱砸教堂，导致玻璃窗损坏。军警无力阻止。这是该教堂自兴建以来第三次遭到攻击。
事发时，基督教堂的崇拜刚结束，信徒都离开了教堂。随后，一群回教徒闯入该教堂，用乱石打砸，肆意破坏，而军警保护无力。
《联合早报》消息说，一名参与攻击行动的回教徒声称攻击教堂的理由"无关宗教信仰"，只因教堂没有建筑野i证。
虽然当局证实没有向受损教堂发出建筑许可证，但基督徒认为这不该是攻击教堂的借口，而且也批评当局对基督徒及教堂保护不作为。
另外，5月29日，日惹当地一所基督徒民宅里聚会也遭到回教徒攻击。屋主、一名8岁男童和几名妇女被一群穿著长袍的男子殴打，当时有两名警员目睹案发经过，但仅抓获一名涉案男子。
另据《亚洲新闻》报导，西爪哇基督教会也受到回教极端势力的骚扰，当局不仅未能履行保护宗教信仰自由的政策，反而以建筑手续不合格为由下令关闭当地七座教堂。
印尼教会建堂需向当局申请许可的手续十分复杂，甚至可能要等上五至十年，还需征得当地居民的同意以及同宗教对话小组展开对话。而且教堂施工常因"不明原因"，被地方当局勒令停工。
