伯特利神学院的课程分别接受不同评审机构评审及认证，其道学硕士及神学学士的牧职课程取得"东南亚神学教协会"的认证，而婚姻及家庭治疗硕士课程则已获"香港专业辅导协会"的证认，亦得到美国"婚姻及家庭治疗协会"接受作为会员的入门要求。
2013年10月31日，伯特利再成为TRACS的会员。该协会是经美国教育部及"高等教育认证协会及高等教育品质保证国际联盟"(IHQAAHE)认可的认证机构。伯特利获认证的课程包括所有证书、文凭、学士、硕士及博士课程。伯特利预计五年内可得到最终认证。
伯特利神学院院长陆辉博士表示，学院朝著提供优质神学教育方向努力。学院在提供优质神学教育方面有三大焦点：第一是努力，期望学院努力办学之余同学亦要尽力学习。第二是在努力至上追求卓越，固学院重视学术要求和符合学术准则。第三是生命的建立，在知识培训外著重生命的培训，以"心"主导技术与恩赐。
