中國神學研究院自今年5月余杰事件後，於7至8月號院訊再次正式交待事件。中神於最新的《中神院訊》裡登刊了涉及事件的中國文化研究中心主任楊慶球博士的文章，詳述整個事件的經過，唯其論點與其5月19日所發表的「余杰到訪取消因由」差別不大，未能為事件提供進一步回應。他覆述，與余杰三月在香港中文大學聚會裡認識，余杰表示希望有機會多學習神學，故此安排他以旁聽身份參加6月份的暑期神學研習班。文中強調該研習班是與內地大學作學術交流，與內地教會及政治因素無關。他在解釋取消余杰旁聽課程的原因時表示，其唯一考慮是「余杰在受到傳媒高度關注的情況下到中神旁聽，學院是否有把握令該博士後研習班能夠不受干擾地進行。」並表示希望為研究生提供理想的學習環境。事件中發出肇事電郵的中心代主任姚西伊博士亦終正面發出感想文章。他對整個事件表示遺憾，因自己一直對余杰訪美之事無意作出評論，而坊間卻把事件簡化為學院因余杰訪美而取消其訪中神資格，令事情鬧大。他又說余杰訪中神純粹是「時機」問題，他期待再有機會安排余杰來訪。在事件發生後，姚博士一直以「事件已告一段落」為理由對傳媒的任何提問保持緘默。中國家庭教會信徒余杰於5月12日在美國對華援助協會網站上發表公開信，表示他與李柏光、王怡三人與布殊總統會見後不久，他即收到香港中神的電郵，内稱中神「鑒於近日引起廣泛關注的某些國際事件」而決定「暫時取消」他原定6月到港訪問研究的計劃。

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這起事件引起香港及國際基督教界及輿論界的廣泛關注，一些評論認為中神此舉有損學術自由，並對香港教會的自我審查日趨嚴重、特區一國兩制遭到破壞感到憂慮。事發後數天中神一直未對事件作出解釋，直至5月15日院長周永健向學生發出電郵解釋余杰事件，強調學院並未受到外界壓力。5月19日學院在其網站發出文章，表示「受到壓力」、「自我審查」或「危害學術自由」等評論純屬傳媒誤會，「並無事實根據」。直至7月初，中神終在院訊對事件再次作出交待。中神曾對本報解釋，由於學院6月份忙於製作畢業禮特刊，故此選擇於7月份院訊登刊此回應文章。