7月1日的第十二届全国人大常委会第十五次会议表决通过了新的《国家安全法》，当中涉及对宗教域的管治，并把港澳与台湾纳入其内，引来境内及海外对宗教事务管理的关注及疑虑。
令人关注的地方是，《国家安全法》在未咨询港台及教会情况下，规管著教会的内地事工，令香港对内地的事工随时有可能触犯《国家安全法》第廿二条而面临被监禁的可能。
大陆实施新《国家安全法》当日，中国福音事工促进会总干事邬小鹤牧师被深圳当局召见约谈，在民族宗教事务局的官员要求下签署了一份名为"宗教事务行政执法责令改正通知书"，指他于2013年起违反大陆有关"境内外国人宗教活动管理规定"。当局要求他在港不得向大陆留学生或来港信徒传福音，甚至在网上发放讯息让内地人到港接受基督教培训亦算违法。
据知目前已有多名本港牧师被广东当局召往大陆约谈，显示大陆已在干涉本港宗教自由，事件令港教会响起警号。
《国家安全法》第11条条文列明："中华人民共和国公民、一切国家机关和武装力量、各政党和各人民团体、企业事业组织和社会组织，都有维护国家安全的责任和义务。中国的主权和领土完整不容分割。维护国家主权、统一和领土完整是包括港澳同胞和台湾同胞在内的全体中国人民的共同义务"，而第36条则表明 :"香港特别行政区、澳门特别行政区应当履行维护国家安全的责任。"
"境外势力"指向港澳与台湾所有宗教团体，香港教会更新运动总干事胡志伟牧师认为当中"干涉境内宗教事务"可说是"语焉不详，无所不包"："这第22条比《基本法》第23条，对教会的内地事工带来更巨大、更直接的影响。"
邬小鹤牧师亦表示，有关官员还向他出示了国家对《境内外国人宗教活动管理规定》及《广东省宗教事务条例》等文件，表示上述上文规管外国人在中国中发展信徒、委任神职人员及传教等。邬牧师质疑该条例指明是针对国内的外国人，不适用于香港，但该官员却声称条例适用于香港，甚至教会也不得向在香港的内地留学生、甚至本身为基督徒的内地游客传福音。
邬牧师又指出，不少香港基督教机构在港举办大型活动或特会、例如在亚洲国际博览馆举行的《回家》特会都有不少内地人赴港参与，新法令这些都变成犯法活动，认为条例明显干涉香港的宗教自由。
