吕牧师见证基神是一所很重视祷告的神学院，喜见学院师生愿意在祷告中经历神的工作，每天不断地被提醒，这成为41年合神心意的传统，也是自身一大优势。
他指出，祷告不能只有神学理论的论述，更需要完成身体力行的操练。因为祷告既是名词，也是动词。渴慕亲近神与经历神，却不祷告，根本是缘木求鱼。因此基神一直努力操练祷告，尤其晨祷会已成为学院生活中极为重要的时刻。
吕牧师介绍了基神师生如何具体操练祷告事奉。周一到周四上课期间，每早上八点钟，所有全时间的学生都到校开始个人灵修。八点二十分群体灵修开始，齐聚小教堂，在讲坛前一起跪下，诗歌赞美，读经分享，祷告代求，享受神的同在，仰望神的工作。
吕牧师强调晨祷不可或缺，因为那时圣灵作工的时刻，他引用邦兹的名言："如果神在我们早晨的思想与努力中不占第一位，那么在其余的时间中，祂就占末位。"
圣徒相通的祷告会似乎逐渐成为失落的操练，但吕牧师为"基神"不仅坚持传承，而且有活力与经历而感恩。他也不断劝勉同学，"祷告是主的吩咐，是我们的需要与渴慕，是与主联合的必要管道。"
作为院长，吕牧师也分享他为基神的祷告内容。"我祷告，基神所培育出来的传道人，在神学院的操练中，养成日后事奉的能力与忠心，成为神国的忠仆，随时举起圣洁的手，为基督的国度与肢体代求。"
"我祷告，神赏赐基神毕业生多有祷告的伙伴，能一同劳苦，带领出能忠心祷告的教会。"他分享说。
