自由亞洲電台報導週一與該院中國研究中心主任楊慶球取得聯絡，楊博士表示邀請余杰來港純屬學術交流，他否認取消邀請涉及任何政治因素。他已向余杰作出道歉，並賠償二人的一切損失。

時代論壇報導，中神院長周永健於5月15日向學生發出電郵交待拒余杰事件，信中只強調學院未受外界壓力，然而仍未向學生進一步具體交待事件。

據時代論壇登刊的電郵，周院長向學生表示：「我想你們知道，事件過程中沒有任何內地或香港政府官員或教會人士與本人或姚博士接觸，而本人與姚博士亦沒有受到任何外界的壓力。此乃純粹學院本身的決定，姚博士在給余杰先生的信中說明了原因。」

中神中國研究中心主任楊慶球博士在4月份中大崇基神學節活動認識中國家庭教會信徒余杰，並親邀其參加中神6月份神學培訓計劃；其後余杰及李柏光等學者於本月11日在白宮會見美國總統布殊，談論中國家庭教會情況，引起國際關注。二人翌日即收到中神電郵，以：「鑒於近日引起廣泛關注的某些國際事件，我們認為目前邀請您來港已不適宜」。為理由，表示已取消其訪問。余杰不滿中神所給理由，在對華援助會網站上公開要求中神道歉。此事引起國際媒體包括BBC報導，關注學術自由的問題。

中神至今仍未清楚交待拒余杰原因，只強調事情「已告一段落」。

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