香港浸信会联会2015年9月宣传举办名为"辨惑归正"的课程，内容涉及简介基督教异端的教派资讯并于内文提及"香港神的教会"。香港神的教会得悉后认为浸联会相有关人士诽谤，其后采取法律行动控告主办机构浸联会、课程导师新兴宗教关注事工总干事杨子聪及张贴海报的爱群道浸信会，要求法庭下令对方登报澄清、道歉及作出赔偿。
2017年在法定调解程序中，香港神的教会先与爱群道浸信会达成和解，该会于同年 10月22日刊登澄清声明。
经过约3年的兴讼，本年4月20日香港神的教会与香港浸信会联会达成和解协议，终止所有法律诉讼，和解协议包括三项：浸联会联于14天内在其网站刊登"澄清道歉启事"为期两周；浸联会通知各成员教会刊登或张贴该启事为期两周；浸联会赔偿香港神的教会部分法律费用。
查实香港浸信会联会2015年年11月已发声明，承认在处理宣传海报上疏忽，但否认就"异端"一词下定义，也坚持没指明任何教派属异端。本年4月20日终在网站刊登"澄清道歉启事"指，"辨惑归正"课程报名表海报网页文稿误指香港神的教会为异端，为令其形象严重受损而致歉，并收回异端言论。
据香港神的教会网页表明其信仰为"笃信圣经、忠毅跟主的基督徒，一直热心作见证，传扬福音真道，按神的话建造合祂心意的教会，而教会所信的与历代基督徒所信的正统信仰相同。"
翻查纪录，在沙士期间抗疫殉职被称为"香港女儿"的谢婉雯医生在香港神的教会决志信主并接受栽培。
