從2003年10月開始籌備並成立研究組的“2004香港教會普查”，目前已收到六成調查問卷的回復。

香港教會普查始於1989年，每5年進行一次，到今年已經是第四次。根據“香港教會研究”網頁所發佈的訊息，教會普查的目的是搜集教會現況的基本資料，如堂會、信徒數目及特徵，事工發展及人力資源等，作為教會事工的檢討與發展的根據；並為各項跟進研究工作提供資料基礎，對香港教會整體事工發展與策略，起重要及深遠性的影響。

從今年7月到10月，教會普查研究組發下他們所設定的問卷，在全港堂會進行普查。截至8月16日，研究組已收到來自714間堂會的回復問卷，回卷率達到六成。而研究組表示，他們的目標是至少獲得七成以上問卷的回收：“每一份收回的‘普查’問卷，都是制定教會未來策略的依據，回卷率愈高，資料分析愈準確，每一份都是神家極為寶貴的資料。”

今年香港教會普查包括全面性的堂會普查、全面性的神學教育機構調查、全面性的教會機構調查、建立及更新全港教會網上資料庫等事項，籍此對香港教會整體發展的特徵作廣泛描述，為香港教會整體事工之發展和檢討提供參考資料，探討教會所面對之處境性課題，並為教會、機構及神學院的各項研究工作提供資料基礎。普查研究組希望透過這些研究資料為全港教會把脈，除了提供各項教會現狀的資料，更提出適切的建議及挑戰，使香港教會健康成長；並為各宗派、分區堂會、教會機構及神學院提供參考資料及資料，協助評估現有的事工，也為日後各項教會研究工作建立基礎。研究組包括擔任主席的中華基督教會香港區會總幹事陸輝牧師，以及13名來自各宗派、機構的牧師和學者。

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上一次香港教會普查在1999年進行。根據其初步結果簡報，全港平均出席崇拜的人數約為18萬，其中15萬7000位是15歲以上的成人，2萬3000位是15歲以下的兒童；居港會友人數約20萬，其中19萬成人，1萬兒童；而在會眾性別比例方面，男性占將近四成，女性占六成多。

然而，參加成人主日學或教導性聚會的會眾只有6萬，是崇拜出席人數的三成八，顯示信徒接受教導的情況極不理想；出席成人團契或小組的人數為7萬3000，僅占崇拜出席人數的四成六，顯示一半以上會眾的肢體生活並不理想。

全港堂會約有2625位受薪教牧同工，其中男性1465位，女性1160位，另有286位義務教牧同工，總共2911位。但堂會中教牧同工的職務空缺高達765位元，占了全部所需教牧同工的兩成，顯示香港堂會極需更多志願獻身事奉的信徒接受神學訓練。此外，根據回卷反映的情況，只有三成傳道同工在同一堂會中牧養達6年或以上，半數傳道同工在過去5年間轉職，其中大部分均為離職，情況非常嚴重。調查結果又估計，約1030位會友在過去的一年接受了神學訓練，平均每間堂會不到一位，但這些神學生也只來自香港約四成的堂會。

而在堂會研究方面，1999年寄回問卷的912間堂會中，近20年間成立的占了一半有多，近10年間成立的也占三成，顯示香港堂會成立年期尚短；全港可容納的最高聚會人數為24萬6000人，大大高於平均出席崇拜的18萬人。這些結果顯示，香港堂會仍然具有發展的空間。

1999年香港教會普查的調查結果、研討文章及回應已集結為《廿一世紀教會牧養與挑戰》一書，於2002年出版。